Настава за ученике у другом циклусу основног образовања и васпитања организована је као предметна, за ученике V разреда и као разредно – предметна, за ученике VI, VII и VIII разреда.
Код израде школског програма за други циклус основног образовања и васпитања основу представља Правилник о наставном плану и програму за ученике лако ментално ометене у развоју („Просветни гласник Р. Србије“ број 33/93). Међутим, избор садржаја, одређивање обима и екстензитета, постављање исхода, избор метода и облика рада, средстава у раду и начин евалуације остварених промена, одређен је специфичностима развојних карактеристика и могућности ученика лако ментално ометених у развоју, као и објективним условима и могућностима организовања васпитно-образовног рада.
Са ученицима са потешкоћама у развоју и учењу образовно-васпитни рад се одвија по индивидуалним образовним плановима, а на основу претходно утврђених потешкоћа у учењу и процене развојних могућности (члан 77. Закона о основама система образовања и вапситања, „Сл. Гласник РС“, бр 72/2009, 52/2011). Индивидуалним образовним планом, за сваког ученика са потешкоћама у развоју се посебно утврђује избор садржаја, по обиму и екстензитету, постављање исхода, избор метода и облика рада, средстава у раду и начини евалуације остварених промена.
Наставни садржаји реализују се у оквиру часова обавезних и обавезних изборних предмета и кроз часове обавезних ваннаставних активности, у раду са ученицима са сложеним сметњама у развоју.
Обавезни предмети за ученике V разреда (Национални образовни програм):
- Српски језик
- Страни језик
- Ликовна култура
- Музичка култура
- Историја
- Географија
- Математика
- Биологија
- Техничко и информатичко образовање
- Физичко васпитање
Изборни наставни предмети за ученике V разреда (Национални образовни програм):
- Домаћинство
- Информатика и рачунарство
Обавезни предмети за ученике VI, VII и VIII разреда (Програм за ученике лако ментално ометене у развоју):
- Српски језик
- Математика
- Природа и друштво
- Техничко образовање са практичним радом
- Музичка култура
- Ликовна култура
- Физичко васпитање
Обавезни изборни предмети за ученике V, VI, VII и VIII разреда
- Грађанско васпитање
- Верска настава
- Чувари природе
- Домаћинство
Као мера додатне подршке у раду са ученицима са сложеним развојним сметњама Школа организује видове специфичне корективно-терпијске подршке:
- Индивидуалне логопедске вежбе
- Индивидуалне психомоторне вежбе
- Корективно-превентивна вежбања
Слободне ваннаставне активности у вишим разредима реализују се кроз ученичке секције.